Mega-Cert proponuje Państwu przeprowadzenie auditów wewnętrznych. Audyty wewnętrzne są to audyty przeprowadzane przez samą organizację lub przez wynajętych specjalistów zewnętrznych, dla potrzeb przeglądu zarządzania lub potwierdzenia zarządowi, że system działa skutecznie. Organizacjom zaleca się przeprowadzenie auditu przez zewnętrznych konsultantów, co daje firmie same korzyści, takie jak oszczędność czasu i środków które należałoby przeznaczyć na szkolenie auditora wewnątrz firmy. Ponadto, organizacji dostarcza się obiektywne i rzetelne wnioski dotyczące mocnych i słabych stron funkcjonującego systemu.